１．通る意为走过，通过，来往，通行，通过,通，开通，渗透，响亮，合格，知名，了解，进入，用法也比较单一例如：ドアを通って中へ入る，通过门进入里面，就是普通的走过通过的意思。今回を通ってなにか勉强になった。通过这次学习学习到了。
２．渡る意为渡过，过，去[远处]，度日，生活，生存，转让，到达。そこを超えて向こう侧につく、水の上に横切って対岸にいく。指的是越过水面上，过河等也用渡る。例句：川を渡る，过河的意思。
３．过ぎる与上面意思完全不同，虽然中文同为过，但指的是太多……。过于…，也表经过的意思。.比如说Vます＋过ぎる 太过于,,, 言い过ぎ就是说的太多。例句约束の时间を过ぎる。约定的时间已经过了。
这三个词只是中文比较相似，但实际意思差别还是挺大的，可以去看下例句深入理解一下会更好记忆。